【導讀】:“超聲波破碎/裂解細胞的常見問題知多少?”有許多客戶反映超聲波破碎和裂解細胞遇到很多問題,今天就由小編來為大家介紹下超聲波破碎/超聲波裂解細胞的常見問題,讓超聲波細胞破碎儀在您的手中使用的得心應手!
大腸桿菌表達外源蛋白,在超聲破碎的時候,用含有1%triton-X-100的PBS懸浮,然后超聲的效果較好,1%triton-X-100的作用還是比較容易看到的,對其他的一些微生物同樣起作用,比如鏈霉菌。
微生物沉淀直接加樣品1buffer,再加5ul的巰基乙醇,混勻,離心,煮沸10min,直接上樣,染色脫色步驟如下:將膠放入適量的染色液微波爐里加熱1min(下次適當補點醋酸),將染色液換成大量的水(自來水)在微波爐煮10min就可以。
在表達重組蛋白后超聲波破碎細胞,采用冰浴,400w,破2s停1s,但是不一會就產生大量泡沫,影響了破碎功率,pbs和tris緩沖液都是這樣,都是破碎不徹底,而我的目的蛋白也在這些未破碎的細胞中。
1*會產生氣泡是因為你的探頭位置沒放好。探頭要接近底部,約1cm(我一般是距底部0.5mm)。功率根據儀器不同會有所不同,但你可以觀察液面,有波動但不要太劇烈就好。
2*破3S停10S,破個二三十次看看。
3*變幅桿位置擺放也要注意,聽聲音如果不對的話就要及時調整。另外可以從菌濃度方面考慮。在破碎時試著加大體積,強度但不要多于60%.
4*嘗試走8s停8s,對有些菌體蛋白來說,你的方法很難散熱,導致蛋白變性產生氣泡,可以讓停頓時間稍長一些,這種情況多見于包涵體形式的蛋白。
鏈霉菌(放線菌)超聲破碎的,用的方法條件是什么?前處理一般就是配置成某濃度的菌懸液。使用超聲破碎時采用的具體條件是:
(1)取菌的24h培養(yǎng)液于5000r/min下離心5min收集菌體.
(2)用pH7.5的Na2HPO-NaH2PO緩沖液洗滌3次,再用該緩沖液將菌體配成1:3的菌懸液.置于40mL大塑料試管內.
(3)將大塑料試管置于冰浴中,采用超聲波破碎(功率200W,1/2”探頭,破碎30s,間歇30S).
(4)破碎液于12000r/min下高速冷凍離心30min,收集細胞碎片和上清夜.
超聲破菌流程與上述基本一致,就是洗滌菌體也可以用預冷的生理鹽水或pH8的Tris-HCl,洗滌一下就可以。另外,超聲劑量隨樣品量、菌體改變比較大,功率可以到400-600w,走5s,停5s,冰浴,要加終濃度1mM的PMSF。為選取合適的超聲強度和次數,需要多多鏡檢觀察菌體是否徹底破碎。
放線菌屬于原核生物系統(tǒng)進化樹上的(G+C)摩爾百分含量(mol%)高的革蘭氏陽性菌(Eubacteria)分枝類群,它雖然具有原核生物特有的分子生物學特性,但在其不同類群中,細胞壁的化學組分變化很大。
在做大腸桿菌超聲時,采用的是400W,走5停5的方法,效果不錯,但是用在鏈霉菌上,似乎沒什么效果。會不會就是由于細胞壁組成差異造成的呢,因為大腸桿菌式屬于革蘭氏陰性菌的。
再有鏡檢是檢驗破碎效果,但是細胞破碎程度和我需要的酶獲得之間有正比關系嗎?破碎時間長也會影響到酶的活性。所以想問問anaisai戰(zhàn)友,你提供的“功率200W,1/2”探頭,破碎30s,間歇30S”的條件好像是用于破碎鏈霉菌孢子的,也可以用于發(fā)酵離心后的菌泥嗎?如果可以,你破碎的時間大概是多少呢?
如果你需要的是胞內酶,細胞破碎程度和需要的酶獲得之間基本上有正比關系。破碎時間長的確會影響到酶的活性。這就需要在較佳的破碎時間和酶活性之間做出判斷,比較直接的辦法是先繪制相關曲線(酶活性和時間的關系曲線)。
實驗中,破碎的是棒狀桿菌(也是很難破壁的G+菌),破碎時間控制在30min左右,酶活較好。如果是基質菌絲的話,好可以考慮用溶菌酶處理一下.一般來講這幾種方法讀可以的:
一,液氮研磨
二,用frenchpress破碎
三,超聲波破碎
四,溶菌酶處理預處理
超聲波是物質介質中的一種彈性機械波,它既是一種波動形式,又是一種能量形式。超聲對細胞的作用主要有熱效應,空化效應和機械效應。熱效應是當超聲在介質中傳播時,摩擦力阻礙了由超聲引起的分子震動,使部分能量轉化為局部高熱(42-43℃)??栈窃诔曊丈湎?,生物體內形成空泡,隨著空泡震動和其猛烈的聚爆而產生出機械剪切壓力和動蕩。另外,空化泡破裂時產生瞬時高溫(約5000℃)、高壓(可達500×104Pa),可使水蒸氣熱解離產生.OH自由基和.H原子,由.OH自由基和.H原子引起的氧化還原反應可導致多聚物降解、酶失活、脂質過氧化和細胞殺傷。機械效應是超聲的原發(fā)效應,超聲波在傳播過程中介質質點交替地壓縮與伸張構成了壓力變化,引起細胞結構損傷。損傷作用的強弱與超聲的頻率和強度密切相關。
100g大腸桿菌溶于1L破碎液里(破碎掖:50mMTris-Cl(PH8.5)5mMEDTA0.14MNaCl),攪拌,發(fā)現菌液發(fā)粘,菌體不能夠迅速分散,用高壓勻質機破碎,加壓后,菌液不能進入勻質機,速度很慢,請問是何原因?能有好的辦法解決,用勻質機快速破碎菌體?將破碎液的量加大,也做不到可能是量太大。超聲處理5-10分鐘,菌液粘度會大大降低,也可促進菌體分散。
不同型號的設備功率不一樣,功率的大小決定了使用變幅桿的大小范圍(直徑2mm至幾十毫米),你使用多大的變幅桿就在設備的上調至該刻度(很簡單的)!變幅桿的大小決定了處理量5ml一下選3mm,5~50ml可選6~8mm,50ml以上選10mm的變幅桿,依此類推!占空比不用關心的,主要是指超聲時間和停頓時間的比值。
酵母破碎的問題
一般的PROTOCOL都是用glassbeads破碎酵母細胞sigmaG-8772酵母破碎效果好的我所做過的方法中還是玻璃珠,效率很高,而且對目的蛋白活性不會有什么影響。一般應該用這個方法。
化學裂解的方法,10g酵母加1ml的乙酸乙酯,攪拌至液體狀。此法的裂解效果不錯的加尿素裂解液(尿素8mol/L,NaCl0.5mol/L,Tris20mmol/L,EDTA20mmol/L,2%SDS,PH值8.0),據說效果可以。
畢氏酵母細胞破碎法
在破碎遇到的問題是菌體濃度太低,OD620nm在4-6之間。細胞破碎儀的低破碎體積為4ml左右,這樣再稀釋一倍,OD就到2-3啦,我們懷疑破碎完溶出蛋白和酶活測定時會測不準。所以請教大家細胞破碎時低菌濃多少為下限?我們的菌是一種棒桿菌。破碎后,你可將液體放入透析袋中濃縮。
我們所做的方法是按照1:20的比例將離心后的菌體(e.coli)溶解于超聲緩沖液(50mM磷酸pH8.0)300w10s/10s破碎20分鐘。做了鏡檢!基本全被破碎了!我做蛋白純化的,做的包涵體。實驗中我們的菌體濃度相對獨立,與培養(yǎng)液中的菌體od無關,不收其限制,便于操作者調控。
一般按每g濕菌體加5-10ml裂菌緩沖液。超聲會產熱,所以需要有降溫裝置,或者你需要得成分耐高溫。(超聲波裂解器,超聲波裂解器廠家,凡帝朗超聲波裂解器,超聲波裂解器價格)
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